余文仪同意柴大纪安抚之策，仅一个多月便陆续有万余贼人来降，且很多地方开始同清军接触，希望得到他们的保护，也愿意为官军剿贼提供钱粮支持。
闽浙总督德保不无高兴道：“林贼已众叛亲离，最多月余，台湾可定。”
福建绿营提督任承恩奏称，叛军名义上虽是由天地会成员组成，实际大半都是福建漳州人士。
然而与叛军作战较为顽强，甚至死不投降的不是官军，而是泉州人。
任承恩分析泉州人之所以帮助官军为叛军为敌，主要是害怕漳州人统治台湾后会损害他们的利益。
因此提出大力招抚泉州人，重点打击漳州人。
细作也探得贼首林爽文多次要求叛军不与泉州人为敌，说什么要一致对抗大清，然而天地会本就是一群乌合之众，没有任何纲领，加上先前漳州人和泉州人在台湾上百年的械斗，两府人间的矛盾根本无法调合。
结果就使得占据台湾人口三分之一的泉州人大部倒向清军，加上天地会义军接连失败，内部分裂，从原有的十万之众锐减到不足两万人，且被清军追的无处落脚，无论从哪个角度看台湾乱事即将平定。
闽浙总督德保甚至上书朝廷，认为应当在台湾设巡抚管辖，从而加大朝廷对台湾的统治，免得岛上那帮汉人动不动再与朝廷为敌。
就在这节骨眼，战事却突然发生重大变化。
首先是福建水师提督黄仕简八百里加急快报，称有洋夷战船寇犯，袭击了清军设在澎湖的粮草转运点，毁我战船4艘，杀我大清兵20余人。
之后福建巡抚余文仪转呈福建绿营提督任承恩急报，任称其得到线报贼首林爽文可能逃窜在台湾南部凤山县一带，因此领兵前往剿灭。
然在与贼兵交战时，突有一支打黑旗的贼军从其侧翼杀来，冲在最前面的除了汉人贼兵外，更有不少深目高梁红发西夷兵丁，人数不低于数百人，所持火枪火炮之犀利远胜我大清兵。
那黑旗兵十分骁勇善战，不仅配备大量火器，贼首更是悍不畏死，屡次亲率贼兵冒箭枝铳子冲阵。
任承恩看的明白，那贼首十分年轻，于冲阵过程中一次冠翎皆碎，一次袍袴皆穿，然却未受毫发之伤。
在其带领下，黑旗贼兵愈战愈勇，官军实在抵挡不住，不得不撤退。
随后，叛军便以那支黑旗贼兵为中坚，纠结大量贼人猛攻台湾府城所在台南，任恩承虽携全城兵壮死守，奈何贼势太大，终是于五天后放弃台南退往嘉义。
台南的失守让本已经苟延残喘的叛军声势复涨，那黑旗军更是扬言要将清军全部赶进大海，然后反攻福建，挥师北上。
说什么“先灭绿营，再平八旗。中国之兵，唯我黑旗！”
鉴于台湾清军全面溃败，弄不好会全军覆没，闽浙总督德保只能请求朝廷速发援军，多派真满大兵、御前侍卫前来，否则怕是再难平定台湾之乱。
军机处议来议去，除了议出台湾叛军有可能勾结西洋人外，对于援军如何派发实是没什么章程。
因为，根本抽不出援军。
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